記念日：1月27日（2月9日）、1月30日（2月12日）（三聖職者の祭日）、9月14日（27日）、11月13日（26日）
生涯
幼少期及び青年期
アンティオキアの名門にて347年頃誕生。
父セクンドスは高名なる軍司令官であったが、子の養育に多大なる影響を与える前に早世し、ヨハネは幼くして父を失う。
母アンテウサは高貴なる家柄の女性。二十歳にして未亡人となり、二人の子と管理を要する遺産を抱え、多くの困難に直面した。当時、同様の境遇の婦人たちは再婚を選ぶこともあったが、アンテウサは全ての縁談を固く拒絶。子女の教育その他の困難を克服する力を得た。その高潔な品性は異教徒の間にも賞賛を集めた。
アンテウサの娘（ヨハネの姉）は早世したと思われる。一方ヨハネは、母より当時の状況下で最良の教育を受けた。
道徳的陶冶に加え、優れた世俗的教養を修める。哲学をアンドラガティオスに、文学・修辞学（その他学問）を当代随一の雄弁家リバニオスに師事。学びの過程で幾度もその才覚を師匠陣に驚嘆させ、後年リバニオスは「最高の弟子」と評した。
恐らくアンテウサは幼少時より聖書の真理を子に教え込んだため、ヨハネは異教文学や世俗的華やかさに惑わされることなく成長した。
青年期・教会への道
必要な学識を修めた後、ヨハネ・クリュソストモスは弁護士として活動し、この分野で輝かしい成功を収めた。その才能と教養、高い社会的地位により、世俗での栄達も約束されていたが、神は彼に別の道を備え給うた。
両親はキリスト教徒であったが、ヨハネ自身は幼時に洗礼を受けていなかった。当時、子供の洗礼を遅らせる慣習は珍しくなかった。多くの親は、子が自覚的に教会に加わることを望んだのである。
やがてヨハネは聖書と教父の著作に深く傾倒し、弁護士業を断ち、修辞学者の称号も捨てた。
この決断に影響を与えたのは、アンティオキア主教メレティオスの招きであった。主教は彼に神の僕としての素質を見出し、教会への貢献を期待して三年間キリスト教教義の指導を施し、ついに洗礼を授けた。
この頃までに、ヨハネの生涯を神に捧げたいという志は固まっていた。当時、主に近づきたいと願う多くの青年が砂漠の隠修士たちに師事し、神の言葉の研究、祈り、観想、肉体労働に励む修道生活を選んでいた。喧騒と堕落に満ちた都市生活とは比べものにならない清貧の道である。
ヨハネも同輩たちと同様に修道者を深く尊敬したが、砂漠には赴かなかった。二つの理由が考えられる――唯一の息子を心の支えとする母の懇願と、メレティオス主教の意向である。
人格の形成
洗礼後まもなく、メレティオス主教は彼を誦経者（聖職者への予備段階）に叙した。
しかし370年、アリウス派を庇護しその反対者を弾圧したウァレンス皇帝の政策により、メレティオスは都市から追放される。
この時期、アンティオキアには他にも著名な教師が残っていた――カルテリオスと、のちタルソス主教となるディオドロスである。ディオドロスの神学学校では、ヨハネと並びテオドロス（モプスエスティアの）が頭角を現した。だがテオドロスが師の神学的特徴を強調・先鋭化させたのに対し、ヨハネは過激さを避け、穏当な解釈を探った。
やがて地元住民の尊敬を集めたヨハネは、友バシレイオスと共に高位の聖職に推されたが、自らを不適格と謙遜して固辞。一方のバシレイオスは主教に叙聖された。
374-375年頃、最愛の母の死を機に、ヨハネは長年の望みを実現――修道院に隠遁した。ここで四年間、断食・徹夜・心の祈りに明け暮れる。
その後、神の摂理により洞窟に移り隠修士として独居。苛烈な禁欲生活と不断の修行が健康を蝕み、胃病を患って生涯苦しむこととなった。
380年、体調悪化により隠遁生活を断念し、アンティオキアに帰還。
輔祭・司祭としての奉職
381年、メレティオスの推挙によりヨハネは輔祭に叙聖された。この時期、輔祭としての通常の礼拝義務に加え、貧困者や弱者への慈善活動にも従事。その奉仕ぶりは単に責任感の強さだけでなく、感受性豊かで共感力に満ちたキリスト者としての姿を示していた。
386年、メレティオスの後継者フラウィアノス主教は39歳のヨハネを司祭に叙聖。この時期、熱心な牧者としてのみならず、卓越した演説家・説教者としても名声を博した。その説教は明晰さ・平易さ・鮮烈な表現力・思想の深さ・正統性が特徴で、既に多くの信徒を惹きつけていた。人々はその教えを聴こうと群れをなした。
388年、軍事税導入に反発したアンティオキア市民が皇帝テオドシウスと后フラキッラの像を破壊する騒動を起こした後、怒りが冷めると共に皇帝の報復を恐れて恐怖に陥った際、ヨハネは信徒に謙遜と悔い改めを呼びかけ、神の慈悲への希望を与えた。この一連の説教は『像について』として現存する。
老齢のフラウィアノス主教は自ら皇帝に市民の赦免を嘆願。その取り成しにより――しかし何よりも神の介入によって――市民は苛烈な報復を免れた。
主教の使命
397年、コンスタンティノポリス大主教ネクタリオスの逝去後、ヨハネ・クリュソストモスはアンティオキアから召還され、空位となった主教座の管理を委ねられることとなった。この時、派遣された使者たちは策略を用いた。アンティオキア市民が愛する牧師を手放すのを拒むと危惧したからである。
ヨハネのコンスタンティノポリス昇格は皇帝アルカディウス自身の意向であった。地元聖職者の良識派と民衆もこれを望んでいた。嫉妬深い者たちが私利を図ろうと反対し陰謀を巡らせたが、397年、ヨハネは壮麗なるコンスタンティノポリス総主教座に就いた。
アレクサンドリア総主教テオフィロスはクリュソストモスの候補を強く拒み、叙聖式への参加を渋ったが、結局は（自らの過ちに対する処罰を恐れて）同意した。
新たな職務は、主教としての責務に相応しく極めて困難を伴うものだった。コンスタンティノポリス市民の道徳水準は低く、貴族は奢侈に溺れ、下層民は貧困に苦しんでいた。地元聖職者の多くもその召命にふさわしくなかった。
状況を変えるため、新総主教は果断な措置を講じた：上流階級を糾弾し、犯罪やキリスト教的義務怠慢で汚名を着た聖職者を罷免し、修道生活の改革を推進し、貧民支援を組織した。
高位聖職者には珍しい質素な生活態度により、ヨハネは同僚からの不理解や露骨な反感を買った。主教座の維持費を大幅に削減し、日々の食事は質素な品数に限り、衣類も（地位に比べ）極めて控えめなものを身に着けた。
節約により生じた資金は慈善事業に充てられた。貧民支援のため、豪華な食器・カーテン・家具・大理石像までも売却して資金を捻出した。
宿敵テオフィロス・アレクサンドリア総主教は、ヨハネの質素なもてなしを侮辱と受け取り、憎悪を増幅させた。
ヨハネのこうした振る舞いは他の主教・司祭たちとの鮮明な対照をなし、彼らに対する非難ともなった。この緊張は次第に闘争へと発展していく。
ある時、ヨハネ・クリュソストモスはテオフィロスからの迫害を逃れてきたニトリア砂漠の四人の修道僧を保護した。彼らの訴えを聞いた後、テオフィロスに仲裁を申し出たが、これは他教区への不当な干渉とみなされた。一方、修道僧たちは皇帝に保護を求め、テオフィロスに対する重い告発を行った。
テオフィロスはコンスタンティノポリスで裁判を受けるよう召喚された。しかし審理が始まると、聖イオアンは最善の意図から裁判を回避するのが適当と判断した。テオフィロスはこの機会を利用して策謀を巡らし、保護したニトリアの修道僧たちがオリゲネス主義者とされていたことから、クリュソストモス自身もオリゲネス主義者だと非難した。
この事件のために「樫の木」と呼ばれる皇帝の別荘で開かれた公会議には、テオフィロスと共に来たエジプトの主教たちが参加した。テオフィロスの同盟者となったのは強力な皇后エウドクシアで、ある寡婦の葡萄園を横領した件でゼザベル王女に例えて非難されたことを恨んでいた。
公会議では出席を拒んだイオアン・クリュソストモスに対し、憶測に基づくものから虚偽の噂まで、いくつもの中傷的な告発がなされた。慈善事業のための貴重品売却は「教会資金の横領」と非難された。
イオアンを支持する聖職者たちの擁護にもかかわらず、彼は有罪判決を受け、エウドクシアの強い要請で皇帝アルカディウスがこれを承認。聖職を剥奪された大主教はニコメディア近郊へ追放された。
この知らせがコンスタンティノポリス中に広まると民衆の暴動が発生。テオフィロスは命からがら首都を脱出せざるを得なかった。
続いて起こった地震は、自らの非を悟ったエウドクシアに神の審判と映り、恐怖に陥れた。皇后の要請で追放が解かれると、市民は大主教を熱狂的に迎えた。新たな公会議は前回の判決を破棄し、全ての告発を取り下げて聖職に復帰させた。
しかし敵対者たちの憎悪は消えていなかった。聖ソフィア大聖堂近くにエウドクシア記念柱が建てられ、異教的で騒々しい祝賀行事が礼拝を妨げた時、イオアン・クリュソストモスは行政長官に抗議。充分な対応が得られないと、今度は皇后を「狂乱するヘロディア」と公に非難した。
この厳しい糾弾にエウドクシアは激怒した。しかし単純に大主教を罰することはできず、再びテオフィロスに接触して裁判を促した。民衆の怒りを恐れたテオフィロスは自ら首都へ赴かず、アカキオスとセウェリノスを使節として送り込み、反クリュソストモス派を糾合して再度の罷免判決を下させた。皇帝はエウドクシアの影響でこれを承認した。
最期の日々
404年復活祭の礼拝中、イオアン・クリュソストモスは逮捕された。一時は自宅軟禁となったが、すぐにビテュニアへ追放。ローマ教皇インノケンティウス1世も事態を変えられなかった。
ビテュニアからは小アルメニアの村ククソスへ移送され、3年間を困窮の中で過ごした。ここで神に仕える著作活動や祈祷、文通に励み、時折アンティオキアからの訪問を受けた。
罷免された大主教の影響力を恐れた敵対者たちは、皇帝に働きかけてさらに辺境のピティウントへの移送を命じさせた。
407年9月14日、長旅に体力を奪われたイオアン・クリュソストモスは目的地に到着することなく永眠した。最期の言葉は「すべてのことに神に栄光を」であった。
まもなく名誉回復された彼は、教会の記憶において傑出した教父、著名なキリスト教著述家として崇敬されている。